1、自主知識產權數量太少
專利數量很重要，申報時知識產權要著重"數量布局 質量取勝”!如果僅僅一兩項發明專利，是不足以在高企認定中獲得評審專家的認可的。建議企業提前做好知識產權的規劃工作，知識產權可以通過轉讓或申請的方式盡快取得與企業主要產品(服務)在技術上發揮核心支持作用的相關知識產權。打算在2023年申請高新認定的企業，至少儲備6項軟著或實用新型或1項發明專利。

2、研發費用歸集困難和占比不足
由于企業在申報時沒有做好相關的規劃，后期在很大程度上拖延了企業的高新申報進程。研發費用歸集是令申報者頭疼的問題，其實研發費用可以歸集的范圍比較廣，研發人員工資、社保，材料費，知識產權申請費，試制費，外包開發費用等等都可以歸集到里面去，具體的可以要求會計按照高新技術企業認定工作指引以及研發費用加計扣除政策文件的歸集要求來，注意申報前各項計劃一定要做好，各個數據硬指標一定要達到。

3、組織管理制度不完善
在申報高企的過程中我們發現，許多原本應具有高新資格的企業并沒有相對完善的研發組織和管理制度，較多的采取的是粗放式管理，不要在最不應該丟分的地方丟了分。完善各項管理制度也是高企申報的重點之一。

4、成果轉化難以體現
成果轉化的形式是多樣化的，比如銷售合同、測試報告、知識產權、技術服務等等，但是企業往往準備時一頭霧水，準備材料繁瑣但是缺乏針對性。

5、數據前后不一致
各報表數據不一致是我們在整理申報材料時發現的普遍問題，如企業所得稅年度納稅申報表、企業年度審計報告、專項審計報告等，注意涉及到主營業務收入、主營業務成本、管理費用、研發支出、職工薪酬、利潤總額等關鍵數據，一定要注意數據的一致性。

6、臨時抱佛腳
有一些企業條件欠缺，沒有提前進行籌劃，臨時抱佛腳做材料，存在材料不真實的問題，為企業后續發展埋下隱患。現在高企認定是趨于嚴格而不是放松，主張早規劃早準備，依規進行合理申報，不符合條件就不要硬申請，早期看似省錢的方式，未來有可能需要更大的代價去彌補，得不償失。